在隐私问题中撤回遗传数据

2017-03-22 09:32:01

作者:Peter Aldhous一种新的法医DNA分析方法为研究常见疾病遗传根源的科学家们带来了意想不到的头痛亚利桑那州凤凰城转化基因组学研究所的David Craig设计了一种统计方法,可以从超过1000人的DNA混合物中鉴定个体DNA谱危险在于该方法允许在遗传研究中可能侵犯志愿者的隐私为了避免这种情况,由美国国立卫生研究院(NIH)领导的研究机构突然从网上提取基因组数据 Craig的方法使用复杂的算法来分析10,000到50,000个称为单核苷酸多态性或SNP的遗传变异这些可以使用标准DNA微阵列“芯片”检测 SNP技术不可能取代传统的法医DNA分析,该分析使用仅13种不同的,高度可变的遗传标记鉴定个体然而,在存在来自几个人的DNA的样品中,这些标记可能难以解释因此,如果警方需要确定特定个体的DNA是否存在于混合样本中,那么SNP方法可能证明是有价值的克雷格认为,这项技术可能会在高调的失踪人员案件中得到应用 - 例如2007年英国女孩玛德琳麦肯在葡萄​​牙失踪他说,在这些调查中,它可能会揭示这个人是否出现在某一特定位置,而这些位置是他们触摸过的表面留下的DNA但是需要进一步的研究来确定该方法是否能够在DNA样本中提供可靠的结果,这些样本已经从这种情况下存在的微量生物化学扩增中进行了生物化学放大 SNP最常用于研究中以定位与疾病易感性相关的基因这些研究的问题是,拥有个体SNP特征 - 或近亲特征 - 的人可以使用克雷格的新统计方法来确定该个体是否参与过基因研究,以及他们是否属于被诊断为疾病,通过分析病例和对照组中每个SNP的整体频率信息这种“全基因组关联”研究的参与者被告知,从这些汇总统计数据中无法获得有关个人的任何信息因此,在获悉Craig的方法后,NIH上周决定从网上删除其全基因组关联研究的摘要数据(参见NIH声明,pdf格式)英国的Wellcome Trust和马萨诸塞州剑桥的Broad研究所也采取措施从公众视角中删除他们的摘要数据 “美国国立卫生研究院在应用预防原则时采取了正确的做法,”华盛顿特区遗传与公共政策中心主任凯西哈德森说科学期刊现在必须考虑如何处理这个问题,因为它们通常在线发布汇总统计数据作为全基因组关联研究论文的补充信息 “我们当然需要考虑它,”科学总编辑莫妮卡布拉德福德说美国国立卫生研究院的统计人员正试图找到方法来发布编辑版的摘要统计数据,而不会有违反隐私的风险但目前,想要从NIH获得这些结果的科学家将不得不单独申请,并同意严格的保密规则对摘要数据集的需求很大,因为它们为遗传学家提供了一种快速方法,可以检查他们发现的关联是否在其他研究中得到证实 “总结统计数据非常有效,可以验证一项发现,而无需从5000人那里收集样本,这可能需要四年时间,”克雷格解释说即使美国国立卫生研究院没有从公开展示中删除信息,对研究志愿者隐私的威胁也会相当小,因为除非有人已经访问过他们的SNP档案,否则不会收集有关个人的信息在上周发布在网上的决定的解释中,美国国立卫生研究院还向研究志愿者保证,他们的财务或其他个人信息从未受到任何风险(见解释,pdf格式)期刊参考:PLoS Genetics DOI:10.137 / journal.pgen1000167遗传学 - 跟上我们不断更新的特别报告中的步伐更多关于这些主题: